《靈飛紀》第二季緊接上季，藏冥山以鬼煞吞元陣毀去京師龍脈，引發屍兵圍困金陵，天下大亂。燕王攜道衍趁機舉兵破防入城，冷霜凝為救眾人而被藏冥山圍攻，朱允炆及柳紅煙等人潛入宮中查探，卻驚聞國難內幕，幾人再度因兵亂離散，天各一方，踏入江湖，此時天下，已經危機四伏……