《紅色派係：發源》的故事將沿用遊戲的布景和人設：自Alec Mason帶領火星殖民地重獲自由已顛末去了25年，而他的妻子被殺，女兒Lyra被綁架也過去了12年，Alec自那時起便已是一名破碎的英雄。他剩下的獨一的兒子，Jake Mason，此刻已經成為了紅派民兵(Red Faction Militia)的軍官，當他發現12年前被綁架的妹妹至今還活著時，他的世界被顛覆了。!vSI"$xd 即使有新的仇敵蜂擁至火星，但Jake依舊決定去尋找他的妹妹，但他發現Lyra此刻卻成了敵對勢力的一員，一個冷血的兵士，發誓要毀掉紅派(Red Faction)。Kate Vernon將扮演The Matriarch，入侵者的族長。