Michael Scofield是一頭陷於絕境欲拚死一搏的怒獅，他的兄弟Lincoln Burrows幾個月就將被以謀殺罪處以死刑，但Michael堅信他是被冤枉的。為了拯救了自己的手足，Michael搶劫了一家銀行，因此而被與Lincoln關進同一所監獄-- 福克斯河州立監獄。作為一名建築工程師，他對監獄的建設藍圖了如指掌，帶著Lincoln逃出生天也成為Michael入獄的唯一目的。年長的犯人改造官Bellick教會了Michael很多監獄的生存之道。後來，在獄友Sucre的幫助下，Michael開始與其他幫派廣泛結盟，包括前匪首John Abruzzi，和聲名狼藉的劫機犯Charles Westmoreland。在監獄外，Michael隻有一個盟友--他的辯護律師和老友Veronica Donovan，她也是Lincoln的前女友。 其間，Lincoln 15歲的兒子LJ，由於沒有了Michael叔叔的正麵影響而開始到處瞎混。其他的角色還包括監獄醫生Sara Tancredi，囚犯Warden Pope，他偽裝出與Michael幾乎如同父子一般的關係。Michael在監獄的日日夜夜，將一步步地發掘出一個使他陷入如此境地的驚天大陰謀。