主要講述了與妹妹一起生活、就讀於都立來禪高中的主人公五河士道，過著平常的生活的他在四月十日遇上了一場大爆炸，而在大爆炸之中出現了被稱作“精靈”的謎之美少女夜刀神十香。精靈是存在於鄰界的特殊災害指定生命體，其出現時會發生空間震，使周圍遭受到很大的災難。十香曾於30年前給地球帶來了大災害，而如今她的再度出現又將會給地球帶來同樣的災難。然而，過著平凡的生活的士道卻能阻止她摧毀地球，那就是要與她約會，就這樣故事正式拉開帷幕。