該劇主要敘述的是人類和塞昂人之間的戰爭，及幸存的五萬人類尋找新的家園地球的故事。

　　在宇宙中未知的地方有一個由12個人類殖民地組成的星際國家，人類為了方便製造了一種擁有獨立思想及感覺的機器人-Cylons為人類服務，但人們怎樣也想不到這些本應是幫助人類的機器人竟會調轉頭對抗自已，Cylons起來反抗人類，人類與自已製造的Cylons之戰爭便開始。

　　在經過十多年漫長、死傷無數的血戰之後雙方停火，Cylons離開了殖民地去建立自己的家園。40年的和平讓人類放鬆了警惕，Cylons製造了一些與人類一模一樣的機器人作間碟滲入人類世界並癱瘓了人類的防禦係統，摧毀了Battlestar艦隊，用核武器將殖民地的城市化為灰燼。Battlestar Galactica是唯一一艘幸存的航母，它在艦長Adama的指揮下帶領幾十艘各式各樣的民船和近5萬名人類僅剩的幸存者逃離了殖民地的星係，開始了尋找人類的第13個殖民地－地球－的旅程。

　　在第二季結尾Cylons占領了人類的新殖民地New Caprica，人類的命運將會如何？