天箕博士是一位量子物理學家,他和他的研究隊伍在進行一次原子撞擊試驗時,突然有兩束光芒從試驗裝置中射出,並且擊中了來參觀的天箕博士的女兒クラウ(12歲).女孩的身體被當場分解,而後又在光芒中重新恢複成人形.博士趕忙停止試驗確認女兒的安危,但眼前的クラウ卻說出了"我名叫RYNAX"
故事會從試驗事故10年後開始,博士的女兒クラウ憑借寄宿在體內的神奇力量成為了暗中維護社會治安的特別諜報員中的佼佼者,但22歲那天,クラウ的體內出現了一個被她自己稱呼為"對"的女孩,還保持著クラウ12歲的形態.更有組織對クラウ的奇異功能發生興趣,想方設法劫持她.
故事設定本身涉及了很多微觀世界的理論,估計意欲借微觀世界中向往外部廣闊世界的RYNAX映射出人類自身的問題.